社团管理中心不仅是全校学生社团的服务、管理机构，还是学校为了丰富学生的课余文化生活、提高学生的艺术修养而设立的校园文化团体，其通过组织学生开展丰富多彩、健康向上的学术、文体及公益活动，以丰富校园文化生活、陶冶大学生文化艺术情操。目前，社团管理中心下设有组织培训部、舞蹈社团服务部、办公室、音乐社团服务部、体育社团服务部、综合社团服务部，共六个部门。

组织培训部作为社团管理中心中的枢纽部门，与各个社团和部门有着紧密的联系，主要负责社团管理中心干部的培训和公示，同时统计与管理各个社团和部门常规活动和精品活动的学分与学时，以及相关综测的记录，并且组织调动学校大型活动的工作人员。

舞蹈社团服务部是社团管理中心管理学校舞蹈类的社团，主要负责大型活动的舞蹈编排、策划、演出，协助其他组织开展活动，审核协助组织社团开展日常活动，提高社团活动质量，是校团委的舞蹈候选主力军，为校团委服务，致力于丰富校园文化，促进校园精神文明建设。

办公室为社团活动的成功举行做好保证，部门主要负责活动所需物资的对接采购搬运，主持活动例如迎新晚会，校园十佳歌手大赛等，同时协助各部门撰写活动相关文件和对组织内部各项资料和档案进行收集和管理，负责学生社团活动前期的材料审核及备案并协助全委会的举行。

音乐社团服务部是社团管理中心中负责分管音乐类社团，旗下部门包含:大学生艺术团流行音乐部，音乐部，新音乐协会，合唱团。每周举办的相应训练，在操场会举行了学校的大型音乐节目，如十佳歌手，草地音乐节等，同时还配合各个组织完成举办的各类活动:提供演职人员并且负责，招募全校有唱歌基础和热爱音乐的同学加入。

体育社团服务部主要是负责管理体育类社团和各大体育赛事活动的后勤保障工作，包括五大联赛等，管理排球社团、篮球社团等二十个体育类社团，随着体育社团活动的有序开展，同学们在运动中增强体育观念，强健体魄，大学生活逐渐丰富多彩。

综合社团服务部是沈阳医学院学生社团管理中心中负责统筹与管理文化兴趣类社团的重要部门，是连接多元学生社团与学生社团管理中心整体发展的桥梁与纽带。部门旗下涵盖了阳光英语俱乐部、DIY梦想手工协会、中医理疗协会等二十余个各具特色的社团。肩负着对所属社团的引导、支持与服务工作，包括协助并审核各社团的日常活动与精品项目开展，确保活动质量与流程规范，并积极协办学校及社团管理中心的各类大型文艺活动，在活动策划、组织协调与人员支持等方面提供坚实保障。